Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Col6a2Q02788 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Col6a2Q02788 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col6a2Q02788 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Col6a2Q02788 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col6a2Q02788 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Col6a2Q02788 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Col6a2Q02788 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Col6a2Q02788 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Col6a2Q02788 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Col6a2Q02788 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Col6a2Q02788 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Col6a2Q02788 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Col6a2Q02788 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Col6a2Q02788 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Col6a2Q02788 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Col6a2Q02788 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Col6a2Q02788 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Col6a2Q02788 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Col6a2Q02788 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col6a2Q02788 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col6a2Q02788 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col6a2Q02788 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col6a2Q02788 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col6a2Q02788 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col6a2Q02788 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col6a2Q02788 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col6a2Q02788 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col6a2Q02788 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col6a2Q02788 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col6a2Q02788 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col6a2Q02788 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Col6a2Q02788 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col6a2Q02788 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col6a2Q02788 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Col6a2Q02788 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col6a2Q02788 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col6a2Q02788 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col6a2Q02788 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Col6a2Q02788 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Col6a2Q02788 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col6a2Q02788 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col6a2Q02788 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col6a2Q02788 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col6a2Q02788 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col6a2Q02788 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col6a2Q02788 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col6a2Q02788 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col6a2Q02788 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col6a2Q02788 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col6a2Q02788 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col6a2Q02788 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col6a2Q02788 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col6a2Q02788 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col6a2Q02788 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col6a2Q02788 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col6a2Q02788 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col6a2Q02788 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col6a2Q02788 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col6a2Q02788 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col6a2Q02788 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col6a2Q02788 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col6a2Q02788 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col6a2Q02788 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col6a2Q02788 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col6a2Q02788 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col6a2Q02788 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col6a2Q02788 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col6a2Q02788 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col6a2Q02788 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col6a2Q02788 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col6a2Q02788 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col6a2Q02788 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col6a2Q02788 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col6a2Q02788 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col6a2Q02788 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col6a2Q02788 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col6a2Q02788 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col6a2Q02788 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col6a2Q02788 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col6a2Q02788 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col6a2Q02788 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Col6a2Q02788 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Col6a2Q02788 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Col6a2Q02788 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Col6a2Q02788 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Col6a2Q02788 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Col6a2Q02788 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Col6a2Q02788 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col6a2Q02788 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col6a2Q02788 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col6a2Q02788 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col6a2Q02788 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col6a2Q02788 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col6a2Q02788 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col6a2Q02788 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col6a2Q02788 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col6a2Q02788 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col6a2Q02788 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col6a2Q02788 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms