Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrkcqQ02111 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrkcqQ02111 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrkcqQ02111 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PrkcqQ02111 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrkcqQ02111 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrkcqQ02111 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrkcqQ02111 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrkcqQ02111 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PrkcqQ02111 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PrkcqQ02111 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PrkcqQ02111 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PrkcqQ02111 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrkcqQ02111 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrkcqQ02111 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrkcqQ02111 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrkcqQ02111 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrkcqQ02111 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PrkcqQ02111 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PrkcqQ02111 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrkcqQ02111 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrkcqQ02111 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrkcqQ02111 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PrkcqQ02111 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PrkcqQ02111 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrkcqQ02111 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrkcqQ02111 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrkcqQ02111 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PrkcqQ02111 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrkcqQ02111 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrkcqQ02111 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrkcqQ02111 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrkcqQ02111 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrkcqQ02111 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrkcqQ02111 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrkcqQ02111 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrkcqQ02111 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrkcqQ02111 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrkcqQ02111 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrkcqQ02111 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrkcqQ02111 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrkcqQ02111 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkcqQ02111 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkcqQ02111 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkcqQ02111 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkcqQ02111 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkcqQ02111 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkcqQ02111 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkcqQ02111 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkcqQ02111 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkcqQ02111 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkcqQ02111 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkcqQ02111 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkcqQ02111 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkcqQ02111 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PrkcqQ02111 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PrkcqQ02111 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PrkcqQ02111 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrkcqQ02111 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrkcqQ02111 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrkcqQ02111 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrkcqQ02111 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrkcqQ02111 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrkcqQ02111 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrkcqQ02111 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrkcqQ02111 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrkcqQ02111 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrkcqQ02111 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrkcqQ02111 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrkcqQ02111 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrkcqQ02111 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PrkcqQ02111 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrkcqQ02111 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrkcqQ02111 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrkcqQ02111 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PrkcqQ02111 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrkcqQ02111 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrkcqQ02111 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrkcqQ02111 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrkcqQ02111 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrkcqQ02111 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrkcqQ02111 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PrkcqQ02111 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrkcqQ02111 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrkcqQ02111 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PrkcqQ02111 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrkcqQ02111 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrkcqQ02111 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrkcqQ02111 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrkcqQ02111 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrkcqQ02111 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrkcqQ02111 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrkcqQ02111 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrkcqQ02111 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrkcqQ02111 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrkcqQ02111 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrkcqQ02111 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrkcqQ02111 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrkcqQ02111 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PrkcqQ02111 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms