Protein–RNA interactions for Protein: P98063

Bmp1, Bone morphogenetic protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmp1P98063 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bmp1P98063 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bmp1P98063 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bmp1P98063 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Bmp1P98063 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Bmp1P98063 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bmp1P98063 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Bmp1P98063 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bmp1P98063 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bmp1P98063 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bmp1P98063 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bmp1P98063 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bmp1P98063 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bmp1P98063 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bmp1P98063 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bmp1P98063 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bmp1P98063 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bmp1P98063 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bmp1P98063 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bmp1P98063 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bmp1P98063 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bmp1P98063 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bmp1P98063 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Bmp1P98063 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bmp1P98063 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Bmp1P98063 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bmp1P98063 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bmp1P98063 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bmp1P98063 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bmp1P98063 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bmp1P98063 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bmp1P98063 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bmp1P98063 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bmp1P98063 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bmp1P98063 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bmp1P98063 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bmp1P98063 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bmp1P98063 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bmp1P98063 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Bmp1P98063 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Bmp1P98063 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Bmp1P98063 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Bmp1P98063 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bmp1P98063 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bmp1P98063 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bmp1P98063 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bmp1P98063 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bmp1P98063 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Bmp1P98063 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Bmp1P98063 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bmp1P98063 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Bmp1P98063 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Bmp1P98063 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Bmp1P98063 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Bmp1P98063 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Bmp1P98063 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Bmp1P98063 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Bmp1P98063 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Bmp1P98063 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Bmp1P98063 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bmp1P98063 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bmp1P98063 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bmp1P98063 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bmp1P98063 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bmp1P98063 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Bmp1P98063 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Bmp1P98063 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Bmp1P98063 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Bmp1P98063 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Bmp1P98063 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Bmp1P98063 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Bmp1P98063 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Bmp1P98063 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Bmp1P98063 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Bmp1P98063 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Bmp1P98063 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bmp1P98063 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bmp1P98063 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bmp1P98063 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bmp1P98063 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bmp1P98063 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Bmp1P98063 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Bmp1P98063 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Bmp1P98063 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Bmp1P98063 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Bmp1P98063 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Bmp1P98063 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Bmp1P98063 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Bmp1P98063 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Bmp1P98063 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bmp1P98063 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bmp1P98063 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bmp1P98063 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bmp1P98063 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bmp1P98063 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Bmp1P98063 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bmp1P98063 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bmp1P98063 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bmp1P98063 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bmp1P98063 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms