Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nbr1P97432 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nbr1P97432 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nbr1P97432 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nbr1P97432 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nbr1P97432 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nbr1P97432 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nbr1P97432 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Nbr1P97432 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Nbr1P97432 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nbr1P97432 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nbr1P97432 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nbr1P97432 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nbr1P97432 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nbr1P97432 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nbr1P97432 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nbr1P97432 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nbr1P97432 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nbr1P97432 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nbr1P97432 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nbr1P97432 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nbr1P97432 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nbr1P97432 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nbr1P97432 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nbr1P97432 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nbr1P97432 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nbr1P97432 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nbr1P97432 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nbr1P97432 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nbr1P97432 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nbr1P97432 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Nbr1P97432 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nbr1P97432 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nbr1P97432 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nbr1P97432 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Nbr1P97432 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nbr1P97432 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nbr1P97432 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nbr1P97432 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nbr1P97432 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nbr1P97432 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nbr1P97432 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nbr1P97432 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Nbr1P97432 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nbr1P97432 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nbr1P97432 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nbr1P97432 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nbr1P97432 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nbr1P97432 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nbr1P97432 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nbr1P97432 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nbr1P97432 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nbr1P97432 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nbr1P97432 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nbr1P97432 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nbr1P97432 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nbr1P97432 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nbr1P97432 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nbr1P97432 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nbr1P97432 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nbr1P97432 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nbr1P97432 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nbr1P97432 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nbr1P97432 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nbr1P97432 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nbr1P97432 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nbr1P97432 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nbr1P97432 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nbr1P97432 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nbr1P97432 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nbr1P97432 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nbr1P97432 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nbr1P97432 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nbr1P97432 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nbr1P97432 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nbr1P97432 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nbr1P97432 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nbr1P97432 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nbr1P97432 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nbr1P97432 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nbr1P97432 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nbr1P97432 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nbr1P97432 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nbr1P97432 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nbr1P97432 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nbr1P97432 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nbr1P97432 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nbr1P97432 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Nbr1P97432 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nbr1P97432 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nbr1P97432 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nbr1P97432 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nbr1P97432 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nbr1P97432 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nbr1P97432 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nbr1P97432 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nbr1P97432 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nbr1P97432 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nbr1P97432 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nbr1P97432 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms