Protein–RNA interactions for Protein: P70424

Erbb2, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erbb2P70424 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Erbb2P70424 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Erbb2P70424 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Erbb2P70424 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Erbb2P70424 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Erbb2P70424 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Erbb2P70424 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Erbb2P70424 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Erbb2P70424 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Erbb2P70424 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Erbb2P70424 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Erbb2P70424 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Erbb2P70424 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Erbb2P70424 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Erbb2P70424 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Erbb2P70424 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Erbb2P70424 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Erbb2P70424 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Erbb2P70424 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Erbb2P70424 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Erbb2P70424 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Erbb2P70424 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Erbb2P70424 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Erbb2P70424 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Erbb2P70424 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Erbb2P70424 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Erbb2P70424 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Erbb2P70424 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Erbb2P70424 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Erbb2P70424 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Erbb2P70424 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Erbb2P70424 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Erbb2P70424 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Erbb2P70424 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Erbb2P70424 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Erbb2P70424 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Erbb2P70424 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Erbb2P70424 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Erbb2P70424 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Erbb2P70424 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Erbb2P70424 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Erbb2P70424 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Erbb2P70424 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Erbb2P70424 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Erbb2P70424 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Erbb2P70424 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Erbb2P70424 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Erbb2P70424 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Erbb2P70424 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Erbb2P70424 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Erbb2P70424 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Erbb2P70424 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Erbb2P70424 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Erbb2P70424 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Erbb2P70424 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Erbb2P70424 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Erbb2P70424 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Erbb2P70424 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Erbb2P70424 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Erbb2P70424 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Erbb2P70424 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Erbb2P70424 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Erbb2P70424 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Erbb2P70424 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Erbb2P70424 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Erbb2P70424 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Erbb2P70424 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Erbb2P70424 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Erbb2P70424 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Erbb2P70424 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Erbb2P70424 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Erbb2P70424 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Erbb2P70424 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Erbb2P70424 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Erbb2P70424 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Erbb2P70424 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Erbb2P70424 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Erbb2P70424 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Erbb2P70424 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Erbb2P70424 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Erbb2P70424 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Erbb2P70424 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Erbb2P70424 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Erbb2P70424 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Erbb2P70424 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Erbb2P70424 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Erbb2P70424 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Erbb2P70424 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Erbb2P70424 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Erbb2P70424 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Erbb2P70424 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Erbb2P70424 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Erbb2P70424 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Erbb2P70424 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Erbb2P70424 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Erbb2P70424 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Erbb2P70424 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Erbb2P70424 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Erbb2P70424 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Erbb2P70424 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms