Protein–RNA interactions for Protein: P63254

Crip1, Cysteine-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crip1P63254 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Crip1P63254 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Crip1P63254 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Crip1P63254 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Crip1P63254 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Crip1P63254 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Crip1P63254 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Crip1P63254 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Crip1P63254 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Crip1P63254 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Crip1P63254 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Crip1P63254 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Crip1P63254 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Crip1P63254 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Crip1P63254 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Crip1P63254 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Crip1P63254 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Crip1P63254 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Crip1P63254 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Crip1P63254 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Crip1P63254 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Crip1P63254 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Crip1P63254 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Crip1P63254 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Crip1P63254 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Crip1P63254 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Crip1P63254 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Crip1P63254 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Crip1P63254 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Crip1P63254 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Crip1P63254 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Crip1P63254 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Crip1P63254 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Crip1P63254 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Crip1P63254 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Crip1P63254 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Crip1P63254 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Crip1P63254 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Crip1P63254 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Crip1P63254 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Crip1P63254 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Crip1P63254 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Crip1P63254 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Crip1P63254 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Crip1P63254 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Crip1P63254 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Crip1P63254 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Crip1P63254 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Crip1P63254 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Crip1P63254 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Crip1P63254 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Crip1P63254 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Crip1P63254 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Crip1P63254 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Crip1P63254 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Crip1P63254 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Crip1P63254 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Crip1P63254 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Crip1P63254 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Crip1P63254 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Crip1P63254 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Crip1P63254 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Crip1P63254 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Crip1P63254 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Crip1P63254 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Crip1P63254 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Crip1P63254 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Crip1P63254 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Crip1P63254 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Crip1P63254 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Crip1P63254 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Crip1P63254 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Crip1P63254 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Crip1P63254 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Crip1P63254 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Crip1P63254 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Crip1P63254 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Crip1P63254 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Crip1P63254 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Crip1P63254 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Crip1P63254 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Crip1P63254 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Crip1P63254 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Crip1P63254 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Crip1P63254 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Crip1P63254 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Crip1P63254 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Crip1P63254 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Crip1P63254 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Crip1P63254 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Crip1P63254 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Crip1P63254 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Crip1P63254 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Crip1P63254 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Crip1P63254 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Crip1P63254 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Crip1P63254 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Crip1P63254 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Crip1P63254 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Crip1P63254 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms