Protein–RNA interactions for Protein: P61022

Chp1, Calcineurin B homologous protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chp1P61022 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chp1P61022 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Chp1P61022 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chp1P61022 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chp1P61022 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chp1P61022 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chp1P61022 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chp1P61022 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chp1P61022 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Chp1P61022 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chp1P61022 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Chp1P61022 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chp1P61022 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chp1P61022 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chp1P61022 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chp1P61022 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chp1P61022 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chp1P61022 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chp1P61022 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chp1P61022 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chp1P61022 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chp1P61022 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Chp1P61022 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chp1P61022 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chp1P61022 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chp1P61022 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chp1P61022 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chp1P61022 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chp1P61022 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Chp1P61022 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Chp1P61022 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chp1P61022 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chp1P61022 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chp1P61022 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chp1P61022 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chp1P61022 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chp1P61022 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chp1P61022 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chp1P61022 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chp1P61022 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chp1P61022 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chp1P61022 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chp1P61022 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chp1P61022 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chp1P61022 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chp1P61022 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chp1P61022 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chp1P61022 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Chp1P61022 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Chp1P61022 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chp1P61022 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chp1P61022 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chp1P61022 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chp1P61022 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Chp1P61022 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chp1P61022 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chp1P61022 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Chp1P61022 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Chp1P61022 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chp1P61022 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chp1P61022 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chp1P61022 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Chp1P61022 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chp1P61022 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chp1P61022 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chp1P61022 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chp1P61022 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chp1P61022 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Chp1P61022 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chp1P61022 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chp1P61022 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chp1P61022 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chp1P61022 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chp1P61022 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chp1P61022 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chp1P61022 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chp1P61022 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chp1P61022 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chp1P61022 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chp1P61022 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chp1P61022 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chp1P61022 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chp1P61022 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chp1P61022 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chp1P61022 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chp1P61022 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chp1P61022 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chp1P61022 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chp1P61022 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chp1P61022 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chp1P61022 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Chp1P61022 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chp1P61022 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Chp1P61022 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chp1P61022 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chp1P61022 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chp1P61022 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chp1P61022 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chp1P61022 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chp1P61022 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms