Protein–RNA interactions for Protein: P46062

Sipa1, Signal-induced proliferation-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sipa1P46062 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sipa1P46062 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sipa1P46062 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sipa1P46062 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sipa1P46062 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sipa1P46062 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sipa1P46062 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sipa1P46062 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sipa1P46062 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sipa1P46062 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sipa1P46062 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sipa1P46062 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sipa1P46062 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sipa1P46062 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sipa1P46062 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sipa1P46062 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sipa1P46062 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sipa1P46062 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sipa1P46062 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sipa1P46062 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sipa1P46062 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sipa1P46062 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sipa1P46062 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sipa1P46062 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sipa1P46062 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sipa1P46062 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sipa1P46062 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sipa1P46062 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sipa1P46062 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sipa1P46062 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sipa1P46062 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sipa1P46062 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sipa1P46062 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sipa1P46062 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sipa1P46062 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sipa1P46062 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sipa1P46062 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sipa1P46062 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sipa1P46062 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sipa1P46062 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sipa1P46062 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sipa1P46062 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sipa1P46062 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sipa1P46062 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sipa1P46062 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sipa1P46062 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sipa1P46062 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sipa1P46062 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sipa1P46062 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Sipa1P46062 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Sipa1P46062 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Sipa1P46062 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sipa1P46062 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sipa1P46062 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sipa1P46062 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sipa1P46062 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sipa1P46062 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sipa1P46062 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sipa1P46062 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sipa1P46062 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sipa1P46062 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sipa1P46062 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sipa1P46062 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sipa1P46062 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sipa1P46062 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sipa1P46062 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sipa1P46062 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sipa1P46062 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sipa1P46062 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sipa1P46062 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sipa1P46062 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sipa1P46062 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sipa1P46062 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sipa1P46062 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sipa1P46062 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sipa1P46062 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sipa1P46062 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sipa1P46062 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sipa1P46062 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sipa1P46062 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sipa1P46062 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sipa1P46062 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sipa1P46062 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sipa1P46062 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sipa1P46062 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Sipa1P46062 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sipa1P46062 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sipa1P46062 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sipa1P46062 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sipa1P46062 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sipa1P46062 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sipa1P46062 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sipa1P46062 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sipa1P46062 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sipa1P46062 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sipa1P46062 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sipa1P46062 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sipa1P46062 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sipa1P46062 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sipa1P46062 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms