Protein–RNA interactions for Protein: P41241

Csk, Tyrosine-protein kinase CSK, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CskP41241 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CskP41241 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CskP41241 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CskP41241 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CskP41241 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CskP41241 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CskP41241 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CskP41241 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CskP41241 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CskP41241 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CskP41241 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CskP41241 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CskP41241 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CskP41241 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CskP41241 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CskP41241 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CskP41241 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CskP41241 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CskP41241 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CskP41241 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CskP41241 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CskP41241 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CskP41241 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CskP41241 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CskP41241 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CskP41241 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CskP41241 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CskP41241 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CskP41241 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CskP41241 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CskP41241 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CskP41241 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CskP41241 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CskP41241 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CskP41241 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CskP41241 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CskP41241 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CskP41241 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CskP41241 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CskP41241 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CskP41241 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CskP41241 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CskP41241 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CskP41241 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CskP41241 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CskP41241 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CskP41241 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CskP41241 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CskP41241 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CskP41241 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CskP41241 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CskP41241 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CskP41241 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CskP41241 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CskP41241 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CskP41241 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CskP41241 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CskP41241 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CskP41241 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CskP41241 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CskP41241 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CskP41241 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CskP41241 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CskP41241 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CskP41241 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CskP41241 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CskP41241 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CskP41241 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CskP41241 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CskP41241 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CskP41241 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CskP41241 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CskP41241 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CskP41241 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CskP41241 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CskP41241 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CskP41241 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CskP41241 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CskP41241 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CskP41241 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CskP41241 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CskP41241 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CskP41241 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CskP41241 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CskP41241 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CskP41241 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CskP41241 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CskP41241 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CskP41241 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CskP41241 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CskP41241 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CskP41241 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CskP41241 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CskP41241 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CskP41241 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CskP41241 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CskP41241 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CskP41241 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CskP41241 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CskP41241 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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