Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rfc1P35601 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rfc1P35601 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rfc1P35601 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Rfc1P35601 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rfc1P35601 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rfc1P35601 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rfc1P35601 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rfc1P35601 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rfc1P35601 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rfc1P35601 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rfc1P35601 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rfc1P35601 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rfc1P35601 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rfc1P35601 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rfc1P35601 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rfc1P35601 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rfc1P35601 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rfc1P35601 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Rfc1P35601 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rfc1P35601 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rfc1P35601 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rfc1P35601 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rfc1P35601 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rfc1P35601 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rfc1P35601 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rfc1P35601 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rfc1P35601 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rfc1P35601 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rfc1P35601 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rfc1P35601 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rfc1P35601 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rfc1P35601 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Rfc1P35601 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Rfc1P35601 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfc1P35601 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfc1P35601 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfc1P35601 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfc1P35601 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfc1P35601 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rfc1P35601 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rfc1P35601 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rfc1P35601 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rfc1P35601 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rfc1P35601 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rfc1P35601 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rfc1P35601 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rfc1P35601 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rfc1P35601 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rfc1P35601 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rfc1P35601 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rfc1P35601 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rfc1P35601 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rfc1P35601 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rfc1P35601 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rfc1P35601 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfc1P35601 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfc1P35601 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfc1P35601 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfc1P35601 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rfc1P35601 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rfc1P35601 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rfc1P35601 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rfc1P35601 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rfc1P35601 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rfc1P35601 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rfc1P35601 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rfc1P35601 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rfc1P35601 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rfc1P35601 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rfc1P35601 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rfc1P35601 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rfc1P35601 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rfc1P35601 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rfc1P35601 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rfc1P35601 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rfc1P35601 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rfc1P35601 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rfc1P35601 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rfc1P35601 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rfc1P35601 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rfc1P35601 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rfc1P35601 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rfc1P35601 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rfc1P35601 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rfc1P35601 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rfc1P35601 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rfc1P35601 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rfc1P35601 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rfc1P35601 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rfc1P35601 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rfc1P35601 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rfc1P35601 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rfc1P35601 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rfc1P35601 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rfc1P35601 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rfc1P35601 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rfc1P35601 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rfc1P35601 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rfc1P35601 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms