Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apoc1P34928 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apoc1P34928 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apoc1P34928 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apoc1P34928 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Apoc1P34928 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Apoc1P34928 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Apoc1P34928 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Apoc1P34928 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apoc1P34928 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apoc1P34928 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apoc1P34928 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apoc1P34928 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apoc1P34928 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apoc1P34928 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apoc1P34928 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apoc1P34928 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apoc1P34928 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apoc1P34928 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apoc1P34928 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apoc1P34928 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apoc1P34928 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Apoc1P34928 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apoc1P34928 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apoc1P34928 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apoc1P34928 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apoc1P34928 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apoc1P34928 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apoc1P34928 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apoc1P34928 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apoc1P34928 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apoc1P34928 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apoc1P34928 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apoc1P34928 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apoc1P34928 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apoc1P34928 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apoc1P34928 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apoc1P34928 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apoc1P34928 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apoc1P34928 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apoc1P34928 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apoc1P34928 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apoc1P34928 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apoc1P34928 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apoc1P34928 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apoc1P34928 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apoc1P34928 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apoc1P34928 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apoc1P34928 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apoc1P34928 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apoc1P34928 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Apoc1P34928 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Apoc1P34928 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apoc1P34928 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apoc1P34928 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Apoc1P34928 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apoc1P34928 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apoc1P34928 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apoc1P34928 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apoc1P34928 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apoc1P34928 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apoc1P34928 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apoc1P34928 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apoc1P34928 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apoc1P34928 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apoc1P34928 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apoc1P34928 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apoc1P34928 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apoc1P34928 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apoc1P34928 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apoc1P34928 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Apoc1P34928 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apoc1P34928 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Apoc1P34928 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apoc1P34928 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apoc1P34928 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apoc1P34928 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apoc1P34928 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apoc1P34928 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Apoc1P34928 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apoc1P34928 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Apoc1P34928 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apoc1P34928 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apoc1P34928 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apoc1P34928 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apoc1P34928 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apoc1P34928 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apoc1P34928 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apoc1P34928 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apoc1P34928 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apoc1P34928 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apoc1P34928 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apoc1P34928 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apoc1P34928 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apoc1P34928 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apoc1P34928 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Apoc1P34928 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apoc1P34928 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apoc1P34928 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apoc1P34928 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms