Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxd9P28357 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxd9P28357 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxd9P28357 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxd9P28357 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxd9P28357 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxd9P28357 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxd9P28357 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxd9P28357 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxd9P28357 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxd9P28357 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxd9P28357 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxd9P28357 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxd9P28357 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxd9P28357 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxd9P28357 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxd9P28357 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxd9P28357 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxd9P28357 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxd9P28357 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxd9P28357 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxd9P28357 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxd9P28357 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxd9P28357 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxd9P28357 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxd9P28357 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxd9P28357 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxd9P28357 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxd9P28357 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hoxd9P28357 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hoxd9P28357 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hoxd9P28357 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hoxd9P28357 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxd9P28357 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxd9P28357 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxd9P28357 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxd9P28357 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxd9P28357 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxd9P28357 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxd9P28357 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxd9P28357 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxd9P28357 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxd9P28357 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxd9P28357 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxd9P28357 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxd9P28357 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxd9P28357 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxd9P28357 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxd9P28357 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxd9P28357 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxd9P28357 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxd9P28357 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxd9P28357 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxd9P28357 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxd9P28357 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxd9P28357 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxd9P28357 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxd9P28357 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxd9P28357 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxd9P28357 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxd9P28357 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxd9P28357 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxd9P28357 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxd9P28357 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxd9P28357 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxd9P28357 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxd9P28357 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxd9P28357 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxd9P28357 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxd9P28357 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxd9P28357 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxd9P28357 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxd9P28357 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxd9P28357 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxd9P28357 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxd9P28357 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxd9P28357 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxd9P28357 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxd9P28357 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxd9P28357 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxd9P28357 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxd9P28357 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxd9P28357 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxd9P28357 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxd9P28357 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxd9P28357 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxd9P28357 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxd9P28357 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxd9P28357 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hoxd9P28357 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hoxd9P28357 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hoxd9P28357 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hoxd9P28357 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxd9P28357 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxd9P28357 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxd9P28357 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxd9P28357 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxd9P28357 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxd9P28357 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxd9P28357 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms