Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ChgaP26339 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ChgaP26339 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ChgaP26339 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ChgaP26339 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ChgaP26339 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ChgaP26339 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ChgaP26339 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ChgaP26339 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ChgaP26339 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ChgaP26339 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ChgaP26339 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ChgaP26339 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ChgaP26339 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ChgaP26339 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ChgaP26339 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ChgaP26339 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ChgaP26339 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ChgaP26339 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ChgaP26339 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ChgaP26339 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ChgaP26339 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ChgaP26339 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ChgaP26339 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ChgaP26339 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ChgaP26339 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ChgaP26339 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ChgaP26339 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ChgaP26339 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ChgaP26339 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ChgaP26339 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ChgaP26339 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ChgaP26339 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ChgaP26339 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ChgaP26339 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ChgaP26339 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ChgaP26339 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ChgaP26339 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ChgaP26339 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ChgaP26339 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ChgaP26339 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ChgaP26339 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ChgaP26339 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ChgaP26339 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ChgaP26339 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ChgaP26339 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ChgaP26339 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ChgaP26339 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ChgaP26339 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ChgaP26339 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ChgaP26339 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ChgaP26339 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ChgaP26339 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ChgaP26339 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ChgaP26339 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ChgaP26339 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ChgaP26339 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ChgaP26339 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ChgaP26339 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ChgaP26339 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ChgaP26339 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ChgaP26339 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ChgaP26339 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ChgaP26339 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ChgaP26339 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ChgaP26339 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ChgaP26339 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ChgaP26339 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ChgaP26339 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ChgaP26339 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ChgaP26339 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ChgaP26339 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ChgaP26339 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ChgaP26339 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ChgaP26339 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ChgaP26339 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ChgaP26339 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ChgaP26339 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ChgaP26339 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ChgaP26339 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ChgaP26339 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ChgaP26339 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ChgaP26339 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ChgaP26339 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ChgaP26339 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ChgaP26339 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ChgaP26339 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ChgaP26339 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ChgaP26339 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ChgaP26339 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ChgaP26339 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ChgaP26339 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ChgaP26339 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ChgaP26339 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ChgaP26339 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ChgaP26339 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ChgaP26339 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ChgaP26339 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ChgaP26339 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ChgaP26339 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms