Protein–RNA interactions for Protein: P16014

Chgb, Secretogranin-1, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgbP16014 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ChgbP16014 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ChgbP16014 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ChgbP16014 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ChgbP16014 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ChgbP16014 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ChgbP16014 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ChgbP16014 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ChgbP16014 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ChgbP16014 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ChgbP16014 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ChgbP16014 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ChgbP16014 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ChgbP16014 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ChgbP16014 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ChgbP16014 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ChgbP16014 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ChgbP16014 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ChgbP16014 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ChgbP16014 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ChgbP16014 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ChgbP16014 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ChgbP16014 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ChgbP16014 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ChgbP16014 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ChgbP16014 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ChgbP16014 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ChgbP16014 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ChgbP16014 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ChgbP16014 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ChgbP16014 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ChgbP16014 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ChgbP16014 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ChgbP16014 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ChgbP16014 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ChgbP16014 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ChgbP16014 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ChgbP16014 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ChgbP16014 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ChgbP16014 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ChgbP16014 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ChgbP16014 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ChgbP16014 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ChgbP16014 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ChgbP16014 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ChgbP16014 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ChgbP16014 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ChgbP16014 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ChgbP16014 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ChgbP16014 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ChgbP16014 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ChgbP16014 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ChgbP16014 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ChgbP16014 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ChgbP16014 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ChgbP16014 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ChgbP16014 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ChgbP16014 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ChgbP16014 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ChgbP16014 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ChgbP16014 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ChgbP16014 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ChgbP16014 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ChgbP16014 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ChgbP16014 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ChgbP16014 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ChgbP16014 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ChgbP16014 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ChgbP16014 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ChgbP16014 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ChgbP16014 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ChgbP16014 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ChgbP16014 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ChgbP16014 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ChgbP16014 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ChgbP16014 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ChgbP16014 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ChgbP16014 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ChgbP16014 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ChgbP16014 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ChgbP16014 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ChgbP16014 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ChgbP16014 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ChgbP16014 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ChgbP16014 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ChgbP16014 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ChgbP16014 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ChgbP16014 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ChgbP16014 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ChgbP16014 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ChgbP16014 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ChgbP16014 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ChgbP16014 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ChgbP16014 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ChgbP16014 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ChgbP16014 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ChgbP16014 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ChgbP16014 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ChgbP16014 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ChgbP16014 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms