Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa1P11477 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa1P11477 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa1P11477 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa1P11477 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa1P11477 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa1P11477 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa1P11477 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa1P11477 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa1P11477 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa1P11477 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa1P11477 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa1P11477 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa1P11477 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa1P11477 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa1P11477 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa1P11477 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa1P11477 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa1P11477 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa1P11477 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa1P11477 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa1P11477 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa1P11477 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa1P11477 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa1P11477 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Defa1P11477 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa1P11477 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa1P11477 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa1P11477 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa1P11477 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa1P11477 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa1P11477 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa1P11477 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa1P11477 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa1P11477 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa1P11477 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa1P11477 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa1P11477 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa1P11477 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa1P11477 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa1P11477 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa1P11477 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa1P11477 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa1P11477 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa1P11477 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa1P11477 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa1P11477 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa1P11477 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa1P11477 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa1P11477 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa1P11477 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa1P11477 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa1P11477 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa1P11477 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa1P11477 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa1P11477 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa1P11477 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa1P11477 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa1P11477 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa1P11477 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa1P11477 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa1P11477 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa1P11477 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa1P11477 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa1P11477 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa1P11477 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa1P11477 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa1P11477 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa1P11477 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa1P11477 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa1P11477 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa1P11477 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa1P11477 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa1P11477 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa1P11477 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa1P11477 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa1P11477 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa1P11477 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa1P11477 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa1P11477 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa1P11477 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa1P11477 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa1P11477 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa1P11477 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa1P11477 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa1P11477 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa1P11477 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa1P11477 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa1P11477 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa1P11477 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa1P11477 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa1P11477 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa1P11477 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa1P11477 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa1P11477 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa1P11477 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa1P11477 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa1P11477 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa1P11477 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa1P11477 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.9 ms