Protein–RNA interactions for Protein: P0C5E4

Ptprq, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, mousemouse

Predictions only

Length 2,300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprqP0C5E4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprqP0C5E4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprqP0C5E4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprqP0C5E4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprqP0C5E4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprqP0C5E4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprqP0C5E4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprqP0C5E4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprqP0C5E4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprqP0C5E4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprqP0C5E4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprqP0C5E4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprqP0C5E4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprqP0C5E4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprqP0C5E4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PtprqP0C5E4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PtprqP0C5E4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtprqP0C5E4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtprqP0C5E4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtprqP0C5E4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PtprqP0C5E4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtprqP0C5E4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtprqP0C5E4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtprqP0C5E4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PtprqP0C5E4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtprqP0C5E4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PtprqP0C5E4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtprqP0C5E4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtprqP0C5E4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprqP0C5E4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprqP0C5E4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprqP0C5E4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprqP0C5E4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprqP0C5E4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprqP0C5E4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprqP0C5E4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprqP0C5E4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprqP0C5E4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprqP0C5E4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprqP0C5E4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprqP0C5E4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprqP0C5E4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprqP0C5E4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprqP0C5E4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprqP0C5E4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprqP0C5E4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprqP0C5E4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprqP0C5E4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprqP0C5E4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprqP0C5E4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprqP0C5E4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprqP0C5E4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprqP0C5E4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprqP0C5E4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprqP0C5E4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprqP0C5E4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprqP0C5E4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprqP0C5E4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtprqP0C5E4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtprqP0C5E4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtprqP0C5E4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtprqP0C5E4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtprqP0C5E4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtprqP0C5E4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtprqP0C5E4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtprqP0C5E4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtprqP0C5E4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
PtprqP0C5E4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtprqP0C5E4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprqP0C5E4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprqP0C5E4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprqP0C5E4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprqP0C5E4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprqP0C5E4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprqP0C5E4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprqP0C5E4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprqP0C5E4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprqP0C5E4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprqP0C5E4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprqP0C5E4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprqP0C5E4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprqP0C5E4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprqP0C5E4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprqP0C5E4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprqP0C5E4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprqP0C5E4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprqP0C5E4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprqP0C5E4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprqP0C5E4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprqP0C5E4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprqP0C5E4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprqP0C5E4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprqP0C5E4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprqP0C5E4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprqP0C5E4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprqP0C5E4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprqP0C5E4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprqP0C5E4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprqP0C5E4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprqP0C5E4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms