Protein–RNA interactions for Protein: P06798

Hoxa4, Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4P06798 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxa4P06798 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxa4P06798 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxa4P06798 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxa4P06798 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxa4P06798 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxa4P06798 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxa4P06798 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxa4P06798 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxa4P06798 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxa4P06798 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxa4P06798 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxa4P06798 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxa4P06798 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxa4P06798 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxa4P06798 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxa4P06798 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxa4P06798 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxa4P06798 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxa4P06798 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxa4P06798 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxa4P06798 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxa4P06798 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxa4P06798 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxa4P06798 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxa4P06798 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxa4P06798 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxa4P06798 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxa4P06798 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxa4P06798 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxa4P06798 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxa4P06798 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxa4P06798 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxa4P06798 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxa4P06798 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxa4P06798 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxa4P06798 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxa4P06798 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxa4P06798 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxa4P06798 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxa4P06798 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxa4P06798 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxa4P06798 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxa4P06798 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxa4P06798 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxa4P06798 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxa4P06798 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxa4P06798 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxa4P06798 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxa4P06798 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxa4P06798 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxa4P06798 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxa4P06798 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxa4P06798 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxa4P06798 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxa4P06798 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxa4P06798 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxa4P06798 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxa4P06798 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxa4P06798 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxa4P06798 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxa4P06798 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxa4P06798 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxa4P06798 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxa4P06798 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxa4P06798 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxa4P06798 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxa4P06798 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxa4P06798 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxa4P06798 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxa4P06798 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxa4P06798 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxa4P06798 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxa4P06798 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxa4P06798 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxa4P06798 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxa4P06798 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxa4P06798 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxa4P06798 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxa4P06798 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxa4P06798 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxa4P06798 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxa4P06798 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxa4P06798 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxa4P06798 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxa4P06798 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxa4P06798 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxa4P06798 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxa4P06798 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxa4P06798 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxa4P06798 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxa4P06798 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxa4P06798 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxa4P06798 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxa4P06798 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxa4P06798 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxa4P06798 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxa4P06798 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxa4P06798 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxa4P06798 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms