Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,49■■■□□ 2,63
Pkd2O35245 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,49■■■□□ 2,63
Pkd2O35245 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31,48■■■□□ 2,63
Pkd2O35245 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,48■■■□□ 2,63
Pkd2O35245 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,48■■■□□ 2,63
Pkd2O35245 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC31,48■■■□□ 2,63
Pkd2O35245 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC31,48■■■□□ 2,63
Pkd2O35245 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,48■■■□□ 2,63
Pkd2O35245 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC31,48■■■□□ 2,63
Pkd2O35245 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,48■■■□□ 2,63
Pkd2O35245 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC31,48■■■□□ 2,63
Pkd2O35245 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,48■■■□□ 2,63
Pkd2O35245 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC31,47■■■□□ 2,63
Pkd2O35245 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,47■■■□□ 2,63
Pkd2O35245 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC31,47■■■□□ 2,63
Pkd2O35245 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC31,47■■■□□ 2,63
Pkd2O35245 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,47■■■□□ 2,63
Pkd2O35245 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC31,47■■■□□ 2,63
Pkd2O35245 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,46■■■□□ 2,63
Pkd2O35245 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC31,46■■■□□ 2,63
Pkd2O35245 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,46■■■□□ 2,63
Pkd2O35245 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,46■■■□□ 2,63
Pkd2O35245 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,45■■■□□ 2,63
Pkd2O35245 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31,45■■■□□ 2,63
Pkd2O35245 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31,45■■■□□ 2,63
Pkd2O35245 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,45■■■□□ 2,63
Pkd2O35245 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,45■■■□□ 2,62
Pkd2O35245 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC31,45■■■□□ 2,62
Pkd2O35245 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31,44■■■□□ 2,62
Pkd2O35245 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC31,44■■■□□ 2,62
Pkd2O35245 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,44■■■□□ 2,62
Pkd2O35245 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,44■■■□□ 2,62
Pkd2O35245 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31,43■■■□□ 2,62
Pkd2O35245 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,43■■■□□ 2,62
Pkd2O35245 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC31,43■■■□□ 2,62
Pkd2O35245 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC31,43■■■□□ 2,62
Pkd2O35245 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,43■■■□□ 2,62
Pkd2O35245 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC31,42■■■□□ 2,62
Pkd2O35245 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC31,42■■■□□ 2,62
Pkd2O35245 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,42■■■□□ 2,62
Pkd2O35245 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC31,41■■■□□ 2,62
Pkd2O35245 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,41■■■□□ 2,62
Pkd2O35245 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,41■■■□□ 2,62
Pkd2O35245 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC31,41■■■□□ 2,62
Pkd2O35245 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,41■■■□□ 2,62
Pkd2O35245 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,4■■■□□ 2,62
Pkd2O35245 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31,4■■■□□ 2,62
Pkd2O35245 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,4■■■□□ 2,62
Pkd2O35245 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC31,4■■■□□ 2,62
Pkd2O35245 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC31,4■■■□□ 2,62
Pkd2O35245 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,39■■■□□ 2,62
Pkd2O35245 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,39■■■□□ 2,61
Pkd2O35245 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,38■■■□□ 2,61
Pkd2O35245 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,38■■■□□ 2,61
Pkd2O35245 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,38■■■□□ 2,61
Pkd2O35245 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,38■■■□□ 2,61
Pkd2O35245 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31,37■■■□□ 2,61
Pkd2O35245 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,37■■■□□ 2,61
Pkd2O35245 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,37■■■□□ 2,61
Pkd2O35245 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,36■■■□□ 2,61
Pkd2O35245 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,36■■■□□ 2,61
Pkd2O35245 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,36■■■□□ 2,61
Pkd2O35245 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,35■■■□□ 2,61
Pkd2O35245 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,34■■■□□ 2,61
Pkd2O35245 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,34■■■□□ 2,61
Pkd2O35245 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,34■■■□□ 2,61
Pkd2O35245 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC31,33■■■□□ 2,61
Pkd2O35245 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,33■■■□□ 2,61
Pkd2O35245 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,32■■■□□ 2,61
Pkd2O35245 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC31,32■■■□□ 2,6
Pkd2O35245 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,32■■■□□ 2,6
Pkd2O35245 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC31,32■■■□□ 2,6
Pkd2O35245 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,31■■■□□ 2,6
Pkd2O35245 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,31■■■□□ 2,6
Pkd2O35245 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,31■■■□□ 2,6
Pkd2O35245 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC31,31■■■□□ 2,6
Pkd2O35245 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,31■■■□□ 2,6
Pkd2O35245 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,31■■■□□ 2,6
Pkd2O35245 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31,3■■■□□ 2,6
Pkd2O35245 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC31,3■■■□□ 2,6
Pkd2O35245 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC31,3■■■□□ 2,6
Pkd2O35245 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,3■■■□□ 2,6
Pkd2O35245 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,3■■■□□ 2,6
Pkd2O35245 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31,29■■■□□ 2,6
Pkd2O35245 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,29■■■□□ 2,6
Pkd2O35245 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC31,29■■■□□ 2,6
Pkd2O35245 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC31,29■■■□□ 2,6
Pkd2O35245 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC31,29■■■□□ 2,6
Pkd2O35245 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,29■■■□□ 2,6
Pkd2O35245 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,29■■■□□ 2,6
Pkd2O35245 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,29■■■□□ 2,6
Pkd2O35245 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,29■■■□□ 2,6
Pkd2O35245 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,28■■■□□ 2,6
Pkd2O35245 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,28■■■□□ 2,6
Pkd2O35245 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC31,28■■■□□ 2,6
Pkd2O35245 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC31,28■■■□□ 2,6
Pkd2O35245 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,27■■■□□ 2,6
Pkd2O35245 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC31,27■■■□□ 2,6
Pkd2O35245 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC31,27■■■□□ 2,6
Pkd2O35245 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC31,27■■■□□ 2,6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14,7 ms