Protein–RNA interactions for Protein: E9PV48

Ifit3b, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3B, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit3bE9PV48 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ifit3bE9PV48 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ifit3bE9PV48 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ifit3bE9PV48 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ifit3bE9PV48 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ifit3bE9PV48 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ifit3bE9PV48 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ifit3bE9PV48 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ifit3bE9PV48 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ifit3bE9PV48 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ifit3bE9PV48 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ifit3bE9PV48 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ifit3bE9PV48 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ifit3bE9PV48 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ifit3bE9PV48 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ifit3bE9PV48 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ifit3bE9PV48 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ifit3bE9PV48 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ifit3bE9PV48 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ifit3bE9PV48 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ifit3bE9PV48 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ifit3bE9PV48 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ifit3bE9PV48 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ifit3bE9PV48 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ifit3bE9PV48 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ifit3bE9PV48 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ifit3bE9PV48 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ifit3bE9PV48 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ifit3bE9PV48 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ifit3bE9PV48 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ifit3bE9PV48 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ifit3bE9PV48 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ifit3bE9PV48 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ifit3bE9PV48 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ifit3bE9PV48 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ifit3bE9PV48 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ifit3bE9PV48 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ifit3bE9PV48 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ifit3bE9PV48 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ifit3bE9PV48 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ifit3bE9PV48 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ifit3bE9PV48 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ifit3bE9PV48 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ifit3bE9PV48 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ifit3bE9PV48 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ifit3bE9PV48 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ifit3bE9PV48 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ifit3bE9PV48 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ifit3bE9PV48 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ifit3bE9PV48 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ifit3bE9PV48 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ifit3bE9PV48 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ifit3bE9PV48 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ifit3bE9PV48 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ifit3bE9PV48 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ifit3bE9PV48 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ifit3bE9PV48 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ifit3bE9PV48 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ifit3bE9PV48 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ifit3bE9PV48 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ifit3bE9PV48 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ifit3bE9PV48 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ifit3bE9PV48 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ifit3bE9PV48 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ifit3bE9PV48 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ifit3bE9PV48 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ifit3bE9PV48 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ifit3bE9PV48 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ifit3bE9PV48 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ifit3bE9PV48 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ifit3bE9PV48 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ifit3bE9PV48 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ifit3bE9PV48 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ifit3bE9PV48 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ifit3bE9PV48 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ifit3bE9PV48 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ifit3bE9PV48 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ifit3bE9PV48 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ifit3bE9PV48 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ifit3bE9PV48 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ifit3bE9PV48 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ifit3bE9PV48 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ifit3bE9PV48 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ifit3bE9PV48 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ifit3bE9PV48 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ifit3bE9PV48 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ifit3bE9PV48 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ifit3bE9PV48 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ifit3bE9PV48 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ifit3bE9PV48 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ifit3bE9PV48 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ifit3bE9PV48 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ifit3bE9PV48 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ifit3bE9PV48 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ifit3bE9PV48 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ifit3bE9PV48 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ifit3bE9PV48 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ifit3bE9PV48 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ifit3bE9PV48 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ifit3bE9PV48 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms