Protein–RNA interactions for Protein: D3YWC7

Fam47e, Family with sequence similarity 47, member E, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam47eD3YWC7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam47eD3YWC7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam47eD3YWC7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam47eD3YWC7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam47eD3YWC7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam47eD3YWC7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam47eD3YWC7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam47eD3YWC7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Fam47eD3YWC7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam47eD3YWC7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam47eD3YWC7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam47eD3YWC7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam47eD3YWC7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam47eD3YWC7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam47eD3YWC7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Fam47eD3YWC7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam47eD3YWC7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Fam47eD3YWC7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam47eD3YWC7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam47eD3YWC7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Fam47eD3YWC7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam47eD3YWC7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam47eD3YWC7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam47eD3YWC7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam47eD3YWC7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam47eD3YWC7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam47eD3YWC7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Fam47eD3YWC7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam47eD3YWC7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam47eD3YWC7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam47eD3YWC7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam47eD3YWC7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam47eD3YWC7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam47eD3YWC7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Fam47eD3YWC7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam47eD3YWC7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Fam47eD3YWC7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Fam47eD3YWC7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam47eD3YWC7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam47eD3YWC7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam47eD3YWC7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam47eD3YWC7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam47eD3YWC7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam47eD3YWC7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam47eD3YWC7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam47eD3YWC7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam47eD3YWC7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam47eD3YWC7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam47eD3YWC7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam47eD3YWC7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam47eD3YWC7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam47eD3YWC7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam47eD3YWC7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam47eD3YWC7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam47eD3YWC7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam47eD3YWC7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam47eD3YWC7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam47eD3YWC7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam47eD3YWC7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam47eD3YWC7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam47eD3YWC7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam47eD3YWC7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam47eD3YWC7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam47eD3YWC7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam47eD3YWC7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam47eD3YWC7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam47eD3YWC7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam47eD3YWC7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam47eD3YWC7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam47eD3YWC7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam47eD3YWC7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam47eD3YWC7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam47eD3YWC7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam47eD3YWC7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam47eD3YWC7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam47eD3YWC7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam47eD3YWC7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam47eD3YWC7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam47eD3YWC7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam47eD3YWC7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam47eD3YWC7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam47eD3YWC7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam47eD3YWC7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam47eD3YWC7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam47eD3YWC7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam47eD3YWC7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam47eD3YWC7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam47eD3YWC7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam47eD3YWC7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam47eD3YWC7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam47eD3YWC7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam47eD3YWC7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam47eD3YWC7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam47eD3YWC7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam47eD3YWC7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam47eD3YWC7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam47eD3YWC7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam47eD3YWC7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam47eD3YWC7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam47eD3YWC7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms