Protein–RNA interactions for Protein: A9Q751

Cfap221, Cilia- and flagella-associated protein 221, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap221A9Q751 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cfap221A9Q751 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cfap221A9Q751 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cfap221A9Q751 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cfap221A9Q751 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cfap221A9Q751 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cfap221A9Q751 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cfap221A9Q751 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cfap221A9Q751 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cfap221A9Q751 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cfap221A9Q751 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cfap221A9Q751 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cfap221A9Q751 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cfap221A9Q751 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cfap221A9Q751 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cfap221A9Q751 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cfap221A9Q751 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cfap221A9Q751 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cfap221A9Q751 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cfap221A9Q751 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cfap221A9Q751 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cfap221A9Q751 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cfap221A9Q751 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cfap221A9Q751 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cfap221A9Q751 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cfap221A9Q751 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cfap221A9Q751 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cfap221A9Q751 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cfap221A9Q751 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cfap221A9Q751 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cfap221A9Q751 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cfap221A9Q751 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cfap221A9Q751 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cfap221A9Q751 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cfap221A9Q751 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cfap221A9Q751 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cfap221A9Q751 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cfap221A9Q751 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cfap221A9Q751 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cfap221A9Q751 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cfap221A9Q751 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cfap221A9Q751 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cfap221A9Q751 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cfap221A9Q751 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cfap221A9Q751 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cfap221A9Q751 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cfap221A9Q751 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cfap221A9Q751 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cfap221A9Q751 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cfap221A9Q751 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cfap221A9Q751 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cfap221A9Q751 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cfap221A9Q751 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cfap221A9Q751 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cfap221A9Q751 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cfap221A9Q751 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cfap221A9Q751 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cfap221A9Q751 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cfap221A9Q751 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cfap221A9Q751 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cfap221A9Q751 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cfap221A9Q751 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cfap221A9Q751 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cfap221A9Q751 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cfap221A9Q751 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cfap221A9Q751 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cfap221A9Q751 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cfap221A9Q751 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cfap221A9Q751 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cfap221A9Q751 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cfap221A9Q751 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cfap221A9Q751 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cfap221A9Q751 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cfap221A9Q751 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cfap221A9Q751 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cfap221A9Q751 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cfap221A9Q751 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cfap221A9Q751 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cfap221A9Q751 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cfap221A9Q751 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cfap221A9Q751 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cfap221A9Q751 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cfap221A9Q751 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cfap221A9Q751 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cfap221A9Q751 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cfap221A9Q751 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cfap221A9Q751 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cfap221A9Q751 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cfap221A9Q751 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cfap221A9Q751 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cfap221A9Q751 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cfap221A9Q751 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cfap221A9Q751 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cfap221A9Q751 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cfap221A9Q751 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cfap221A9Q751 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cfap221A9Q751 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cfap221A9Q751 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cfap221A9Q751 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cfap221A9Q751 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms