Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nlrp1bA1Z198 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nlrp1bA1Z198 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrp1bA1Z198 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrp1bA1Z198 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrp1bA1Z198 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrp1bA1Z198 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrp1bA1Z198 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrp1bA1Z198 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrp1bA1Z198 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrp1bA1Z198 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrp1bA1Z198 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrp1bA1Z198 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrp1bA1Z198 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrp1bA1Z198 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrp1bA1Z198 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrp1bA1Z198 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrp1bA1Z198 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrp1bA1Z198 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrp1bA1Z198 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrp1bA1Z198 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrp1bA1Z198 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrp1bA1Z198 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrp1bA1Z198 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrp1bA1Z198 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrp1bA1Z198 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlrp1bA1Z198 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlrp1bA1Z198 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlrp1bA1Z198 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlrp1bA1Z198 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlrp1bA1Z198 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlrp1bA1Z198 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nlrp1bA1Z198 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nlrp1bA1Z198 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nlrp1bA1Z198 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nlrp1bA1Z198 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nlrp1bA1Z198 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nlrp1bA1Z198 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nlrp1bA1Z198 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nlrp1bA1Z198 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nlrp1bA1Z198 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Nlrp1bA1Z198 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nlrp1bA1Z198 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nlrp1bA1Z198 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nlrp1bA1Z198 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nlrp1bA1Z198 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Nlrp1bA1Z198 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nlrp1bA1Z198 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Nlrp1bA1Z198 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nlrp1bA1Z198 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlrp1bA1Z198 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlrp1bA1Z198 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlrp1bA1Z198 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlrp1bA1Z198 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlrp1bA1Z198 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlrp1bA1Z198 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlrp1bA1Z198 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlrp1bA1Z198 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nlrp1bA1Z198 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nlrp1bA1Z198 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nlrp1bA1Z198 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Nlrp1bA1Z198 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nlrp1bA1Z198 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nlrp1bA1Z198 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nlrp1bA1Z198 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nlrp1bA1Z198 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Nlrp1bA1Z198 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Nlrp1bA1Z198 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nlrp1bA1Z198 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nlrp1bA1Z198 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrp1bA1Z198 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrp1bA1Z198 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrp1bA1Z198 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrp1bA1Z198 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrp1bA1Z198 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrp1bA1Z198 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrp1bA1Z198 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrp1bA1Z198 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrp1bA1Z198 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrp1bA1Z198 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrp1bA1Z198 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Nlrp1bA1Z198 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Nlrp1bA1Z198 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlrp1bA1Z198 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlrp1bA1Z198 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlrp1bA1Z198 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlrp1bA1Z198 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlrp1bA1Z198 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlrp1bA1Z198 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrp1bA1Z198 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrp1bA1Z198 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrp1bA1Z198 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrp1bA1Z198 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrp1bA1Z198 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrp1bA1Z198 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrp1bA1Z198 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrp1bA1Z198 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrp1bA1Z198 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nlrp1bA1Z198 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nlrp1bA1Z198 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms