Protein–RNA interactions for Protein: A1L3C1

Fam71e1, Protein FAM71E1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71e1A1L3C1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Fam71e1A1L3C1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Fam71e1A1L3C1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Fam71e1A1L3C1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Fam71e1A1L3C1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Fam71e1A1L3C1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Fam71e1A1L3C1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Fam71e1A1L3C1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Fam71e1A1L3C1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Fam71e1A1L3C1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Fam71e1A1L3C1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Fam71e1A1L3C1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Fam71e1A1L3C1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Fam71e1A1L3C1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Fam71e1A1L3C1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Fam71e1A1L3C1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Fam71e1A1L3C1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Fam71e1A1L3C1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Fam71e1A1L3C1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Fam71e1A1L3C1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Fam71e1A1L3C1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Fam71e1A1L3C1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Fam71e1A1L3C1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Fam71e1A1L3C1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Fam71e1A1L3C1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Fam71e1A1L3C1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Fam71e1A1L3C1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Fam71e1A1L3C1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Fam71e1A1L3C1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Fam71e1A1L3C1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Fam71e1A1L3C1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Fam71e1A1L3C1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Fam71e1A1L3C1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Fam71e1A1L3C1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Fam71e1A1L3C1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Fam71e1A1L3C1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Fam71e1A1L3C1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Fam71e1A1L3C1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Fam71e1A1L3C1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Fam71e1A1L3C1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Fam71e1A1L3C1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Fam71e1A1L3C1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Fam71e1A1L3C1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Fam71e1A1L3C1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Fam71e1A1L3C1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Fam71e1A1L3C1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Fam71e1A1L3C1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Fam71e1A1L3C1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Fam71e1A1L3C1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Fam71e1A1L3C1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Fam71e1A1L3C1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Fam71e1A1L3C1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Fam71e1A1L3C1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Fam71e1A1L3C1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Fam71e1A1L3C1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Fam71e1A1L3C1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Fam71e1A1L3C1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Fam71e1A1L3C1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Fam71e1A1L3C1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Fam71e1A1L3C1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Fam71e1A1L3C1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Fam71e1A1L3C1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Fam71e1A1L3C1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Fam71e1A1L3C1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Fam71e1A1L3C1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Fam71e1A1L3C1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Fam71e1A1L3C1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Fam71e1A1L3C1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Fam71e1A1L3C1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Fam71e1A1L3C1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Fam71e1A1L3C1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Fam71e1A1L3C1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Fam71e1A1L3C1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Fam71e1A1L3C1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Fam71e1A1L3C1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Fam71e1A1L3C1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Fam71e1A1L3C1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Fam71e1A1L3C1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Fam71e1A1L3C1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Fam71e1A1L3C1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Fam71e1A1L3C1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Fam71e1A1L3C1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Fam71e1A1L3C1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Fam71e1A1L3C1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Fam71e1A1L3C1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Fam71e1A1L3C1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Fam71e1A1L3C1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Fam71e1A1L3C1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Fam71e1A1L3C1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Fam71e1A1L3C1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Fam71e1A1L3C1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Fam71e1A1L3C1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Fam71e1A1L3C1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Fam71e1A1L3C1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Fam71e1A1L3C1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Fam71e1A1L3C1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Fam71e1A1L3C1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Fam71e1A1L3C1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Fam71e1A1L3C1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Fam71e1A1L3C1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms