Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WR25

Gm28360, Predicted gene 28360, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28360A0A087WR25 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm28360A0A087WR25 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm28360A0A087WR25 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm28360A0A087WR25 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm28360A0A087WR25 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm28360A0A087WR25 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm28360A0A087WR25 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm28360A0A087WR25 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm28360A0A087WR25 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm28360A0A087WR25 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm28360A0A087WR25 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm28360A0A087WR25 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm28360A0A087WR25 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm28360A0A087WR25 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm28360A0A087WR25 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm28360A0A087WR25 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm28360A0A087WR25 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm28360A0A087WR25 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm28360A0A087WR25 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm28360A0A087WR25 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm28360A0A087WR25 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm28360A0A087WR25 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm28360A0A087WR25 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm28360A0A087WR25 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm28360A0A087WR25 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm28360A0A087WR25 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm28360A0A087WR25 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm28360A0A087WR25 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm28360A0A087WR25 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm28360A0A087WR25 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm28360A0A087WR25 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm28360A0A087WR25 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm28360A0A087WR25 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm28360A0A087WR25 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm28360A0A087WR25 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm28360A0A087WR25 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm28360A0A087WR25 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm28360A0A087WR25 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm28360A0A087WR25 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm28360A0A087WR25 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm28360A0A087WR25 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm28360A0A087WR25 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm28360A0A087WR25 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm28360A0A087WR25 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm28360A0A087WR25 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm28360A0A087WR25 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm28360A0A087WR25 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm28360A0A087WR25 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm28360A0A087WR25 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm28360A0A087WR25 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm28360A0A087WR25 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm28360A0A087WR25 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm28360A0A087WR25 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm28360A0A087WR25 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm28360A0A087WR25 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm28360A0A087WR25 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gm28360A0A087WR25 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gm28360A0A087WR25 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gm28360A0A087WR25 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gm28360A0A087WR25 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm28360A0A087WR25 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm28360A0A087WR25 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm28360A0A087WR25 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm28360A0A087WR25 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm28360A0A087WR25 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm28360A0A087WR25 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm28360A0A087WR25 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm28360A0A087WR25 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm28360A0A087WR25 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm28360A0A087WR25 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm28360A0A087WR25 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm28360A0A087WR25 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm28360A0A087WR25 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm28360A0A087WR25 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm28360A0A087WR25 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm28360A0A087WR25 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm28360A0A087WR25 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm28360A0A087WR25 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm28360A0A087WR25 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm28360A0A087WR25 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm28360A0A087WR25 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm28360A0A087WR25 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm28360A0A087WR25 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm28360A0A087WR25 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm28360A0A087WR25 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm28360A0A087WR25 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm28360A0A087WR25 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm28360A0A087WR25 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm28360A0A087WR25 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm28360A0A087WR25 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm28360A0A087WR25 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm28360A0A087WR25 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm28360A0A087WR25 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm28360A0A087WR25 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm28360A0A087WR25 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm28360A0A087WR25 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm28360A0A087WR25 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm28360A0A087WR25 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm28360A0A087WR25 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm28360A0A087WR25 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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