Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP4

SDHAF3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF3Q9NRP4 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms