Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CICQ96RK0 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CICQ96RK0 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CICQ96RK0 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CICQ96RK0 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CICQ96RK0 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CICQ96RK0 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CICQ96RK0 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CICQ96RK0 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CICQ96RK0 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CICQ96RK0 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CICQ96RK0 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CICQ96RK0 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CICQ96RK0 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CICQ96RK0 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CICQ96RK0 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CICQ96RK0 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CICQ96RK0 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CICQ96RK0 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CICQ96RK0 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CICQ96RK0 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CICQ96RK0 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CICQ96RK0 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CICQ96RK0 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CICQ96RK0 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CICQ96RK0 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CICQ96RK0 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CICQ96RK0 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CICQ96RK0 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CICQ96RK0 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CICQ96RK0 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CICQ96RK0 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CICQ96RK0 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CICQ96RK0 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CICQ96RK0 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CICQ96RK0 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CICQ96RK0 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CICQ96RK0 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CICQ96RK0 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CICQ96RK0 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CICQ96RK0 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CICQ96RK0 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CICQ96RK0 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CICQ96RK0 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CICQ96RK0 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CICQ96RK0 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CICQ96RK0 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CICQ96RK0 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CICQ96RK0 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CICQ96RK0 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CICQ96RK0 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CICQ96RK0 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CICQ96RK0 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CICQ96RK0 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CICQ96RK0 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CICQ96RK0 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CICQ96RK0 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CICQ96RK0 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CICQ96RK0 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CICQ96RK0 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CICQ96RK0 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CICQ96RK0 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CICQ96RK0 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CICQ96RK0 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CICQ96RK0 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CICQ96RK0 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CICQ96RK0 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CICQ96RK0 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CICQ96RK0 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CICQ96RK0 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CICQ96RK0 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CICQ96RK0 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CICQ96RK0 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CICQ96RK0 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CICQ96RK0 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CICQ96RK0 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CICQ96RK0 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CICQ96RK0 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CICQ96RK0 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CICQ96RK0 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CICQ96RK0 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CICQ96RK0 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CICQ96RK0 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CICQ96RK0 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CICQ96RK0 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CICQ96RK0 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CICQ96RK0 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CICQ96RK0 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CICQ96RK0 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CICQ96RK0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CICQ96RK0 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CICQ96RK0 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CICQ96RK0 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CICQ96RK0 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CICQ96RK0 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CICQ96RK0 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CICQ96RK0 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CICQ96RK0 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CICQ96RK0 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CICQ96RK0 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms