Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX27Q96L92 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms