Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms