Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFU8

Slc17a8, Vesicular glutamate transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc17a8Q8BFU8 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc17a8Q8BFU8 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc17a8Q8BFU8 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc17a8Q8BFU8 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc17a8Q8BFU8 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc17a8Q8BFU8 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc17a8Q8BFU8 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc17a8Q8BFU8 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc17a8Q8BFU8 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc17a8Q8BFU8 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc17a8Q8BFU8 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc17a8Q8BFU8 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc17a8Q8BFU8 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc17a8Q8BFU8 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc17a8Q8BFU8 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc17a8Q8BFU8 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc17a8Q8BFU8 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc17a8Q8BFU8 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc17a8Q8BFU8 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc17a8Q8BFU8 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc17a8Q8BFU8 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc17a8Q8BFU8 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc17a8Q8BFU8 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc17a8Q8BFU8 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc17a8Q8BFU8 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc17a8Q8BFU8 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc17a8Q8BFU8 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc17a8Q8BFU8 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc17a8Q8BFU8 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc17a8Q8BFU8 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc17a8Q8BFU8 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc17a8Q8BFU8 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc17a8Q8BFU8 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc17a8Q8BFU8 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc17a8Q8BFU8 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc17a8Q8BFU8 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc17a8Q8BFU8 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc17a8Q8BFU8 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc17a8Q8BFU8 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc17a8Q8BFU8 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc17a8Q8BFU8 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc17a8Q8BFU8 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc17a8Q8BFU8 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc17a8Q8BFU8 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc17a8Q8BFU8 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc17a8Q8BFU8 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms