Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms