Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms