Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lamb3Q61087 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lamb3Q61087 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lamb3Q61087 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lamb3Q61087 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lamb3Q61087 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lamb3Q61087 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lamb3Q61087 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lamb3Q61087 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lamb3Q61087 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lamb3Q61087 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lamb3Q61087 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lamb3Q61087 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lamb3Q61087 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lamb3Q61087 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lamb3Q61087 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lamb3Q61087 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lamb3Q61087 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lamb3Q61087 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lamb3Q61087 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lamb3Q61087 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lamb3Q61087 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lamb3Q61087 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lamb3Q61087 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lamb3Q61087 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lamb3Q61087 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lamb3Q61087 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lamb3Q61087 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lamb3Q61087 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lamb3Q61087 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lamb3Q61087 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lamb3Q61087 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lamb3Q61087 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lamb3Q61087 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lamb3Q61087 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lamb3Q61087 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lamb3Q61087 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lamb3Q61087 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lamb3Q61087 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lamb3Q61087 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lamb3Q61087 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lamb3Q61087 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lamb3Q61087 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lamb3Q61087 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lamb3Q61087 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lamb3Q61087 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lamb3Q61087 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lamb3Q61087 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lamb3Q61087 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lamb3Q61087 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lamb3Q61087 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lamb3Q61087 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lamb3Q61087 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lamb3Q61087 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lamb3Q61087 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lamb3Q61087 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lamb3Q61087 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lamb3Q61087 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lamb3Q61087 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lamb3Q61087 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lamb3Q61087 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lamb3Q61087 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lamb3Q61087 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lamb3Q61087 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lamb3Q61087 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lamb3Q61087 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lamb3Q61087 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lamb3Q61087 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lamb3Q61087 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lamb3Q61087 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lamb3Q61087 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms