Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms