Protein–RNA interactions for Protein: P46735

Myo1b, Unconventional myosin-Ib, mousemouse

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo1bP46735 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Myo1bP46735 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Myo1bP46735 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms