Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms