Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms