Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms