Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms