Protein–RNA interactions for Protein: Q80V63

Prdm4, PR domain zinc finger protein 4, mousemouse

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Length 803 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm4Q80V63 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prdm4Q80V63 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prdm4Q80V63 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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