Protein–RNA interactions for Protein: Q6U736

OPN5, Opsin-5, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN5Q6U736 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OPN5Q6U736 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms