Protein–RNA interactions for Protein: Q62018

Ctr9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctr9Q62018 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctr9Q62018 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctr9Q62018 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctr9Q62018 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctr9Q62018 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctr9Q62018 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctr9Q62018 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctr9Q62018 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctr9Q62018 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctr9Q62018 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctr9Q62018 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctr9Q62018 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctr9Q62018 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctr9Q62018 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctr9Q62018 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctr9Q62018 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctr9Q62018 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctr9Q62018 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctr9Q62018 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctr9Q62018 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctr9Q62018 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctr9Q62018 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctr9Q62018 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctr9Q62018 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctr9Q62018 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctr9Q62018 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctr9Q62018 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctr9Q62018 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctr9Q62018 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctr9Q62018 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctr9Q62018 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctr9Q62018 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctr9Q62018 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctr9Q62018 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctr9Q62018 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctr9Q62018 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctr9Q62018 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctr9Q62018 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctr9Q62018 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctr9Q62018 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctr9Q62018 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctr9Q62018 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctr9Q62018 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctr9Q62018 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctr9Q62018 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctr9Q62018 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctr9Q62018 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctr9Q62018 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctr9Q62018 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctr9Q62018 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctr9Q62018 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctr9Q62018 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctr9Q62018 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctr9Q62018 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctr9Q62018 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctr9Q62018 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctr9Q62018 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctr9Q62018 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctr9Q62018 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctr9Q62018 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctr9Q62018 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctr9Q62018 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctr9Q62018 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctr9Q62018 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctr9Q62018 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctr9Q62018 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctr9Q62018 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctr9Q62018 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctr9Q62018 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctr9Q62018 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctr9Q62018 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctr9Q62018 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctr9Q62018 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctr9Q62018 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctr9Q62018 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctr9Q62018 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctr9Q62018 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctr9Q62018 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctr9Q62018 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctr9Q62018 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctr9Q62018 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctr9Q62018 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctr9Q62018 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctr9Q62018 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctr9Q62018 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctr9Q62018 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctr9Q62018 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctr9Q62018 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctr9Q62018 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctr9Q62018 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctr9Q62018 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctr9Q62018 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctr9Q62018 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctr9Q62018 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctr9Q62018 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctr9Q62018 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctr9Q62018 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctr9Q62018 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctr9Q62018 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctr9Q62018 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms