Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EXT1Q16394 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EXT1Q16394 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EXT1Q16394 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EXT1Q16394 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EXT1Q16394 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EXT1Q16394 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EXT1Q16394 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
EXT1Q16394 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EXT1Q16394 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EXT1Q16394 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EXT1Q16394 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EXT1Q16394 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EXT1Q16394 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EXT1Q16394 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
EXT1Q16394 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EXT1Q16394 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EXT1Q16394 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EXT1Q16394 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EXT1Q16394 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
EXT1Q16394 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EXT1Q16394 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
EXT1Q16394 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EXT1Q16394 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EXT1Q16394 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EXT1Q16394 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EXT1Q16394 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EXT1Q16394 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EXT1Q16394 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EXT1Q16394 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EXT1Q16394 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EXT1Q16394 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EXT1Q16394 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EXT1Q16394 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EXT1Q16394 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EXT1Q16394 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EXT1Q16394 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EXT1Q16394 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EXT1Q16394 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EXT1Q16394 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EXT1Q16394 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EXT1Q16394 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EXT1Q16394 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EXT1Q16394 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EXT1Q16394 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EXT1Q16394 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EXT1Q16394 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EXT1Q16394 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EXT1Q16394 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EXT1Q16394 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EXT1Q16394 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EXT1Q16394 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EXT1Q16394 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EXT1Q16394 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EXT1Q16394 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EXT1Q16394 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EXT1Q16394 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
EXT1Q16394 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EXT1Q16394 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EXT1Q16394 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EXT1Q16394 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EXT1Q16394 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EXT1Q16394 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EXT1Q16394 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EXT1Q16394 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
EXT1Q16394 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EXT1Q16394 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EXT1Q16394 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EXT1Q16394 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EXT1Q16394 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EXT1Q16394 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EXT1Q16394 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EXT1Q16394 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
EXT1Q16394 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EXT1Q16394 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EXT1Q16394 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EXT1Q16394 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EXT1Q16394 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EXT1Q16394 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EXT1Q16394 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EXT1Q16394 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
EXT1Q16394 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EXT1Q16394 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EXT1Q16394 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EXT1Q16394 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EXT1Q16394 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EXT1Q16394 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EXT1Q16394 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EXT1Q16394 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EXT1Q16394 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EXT1Q16394 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EXT1Q16394 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EXT1Q16394 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EXT1Q16394 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EXT1Q16394 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EXT1Q16394 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
EXT1Q16394 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EXT1Q16394 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EXT1Q16394 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EXT1Q16394 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms