Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms