Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
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