Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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