Protein–RNA interactions for Protein: P27695

APEX1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX1P27695 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APEX1P27695 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APEX1P27695 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APEX1P27695 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APEX1P27695 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APEX1P27695 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APEX1P27695 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APEX1P27695 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APEX1P27695 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APEX1P27695 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APEX1P27695 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APEX1P27695 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APEX1P27695 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APEX1P27695 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APEX1P27695 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
APEX1P27695 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
APEX1P27695 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
APEX1P27695 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APEX1P27695 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
APEX1P27695 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APEX1P27695 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APEX1P27695 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APEX1P27695 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APEX1P27695 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APEX1P27695 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APEX1P27695 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APEX1P27695 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APEX1P27695 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APEX1P27695 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APEX1P27695 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APEX1P27695 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APEX1P27695 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APEX1P27695 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APEX1P27695 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APEX1P27695 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APEX1P27695 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APEX1P27695 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APEX1P27695 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APEX1P27695 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APEX1P27695 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APEX1P27695 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APEX1P27695 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APEX1P27695 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APEX1P27695 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APEX1P27695 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APEX1P27695 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APEX1P27695 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APEX1P27695 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APEX1P27695 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APEX1P27695 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APEX1P27695 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APEX1P27695 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APEX1P27695 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APEX1P27695 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APEX1P27695 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APEX1P27695 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APEX1P27695 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APEX1P27695 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APEX1P27695 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APEX1P27695 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
APEX1P27695 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APEX1P27695 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APEX1P27695 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APEX1P27695 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APEX1P27695 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APEX1P27695 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APEX1P27695 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APEX1P27695 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APEX1P27695 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APEX1P27695 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APEX1P27695 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APEX1P27695 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APEX1P27695 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APEX1P27695 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APEX1P27695 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APEX1P27695 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APEX1P27695 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APEX1P27695 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APEX1P27695 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APEX1P27695 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
APEX1P27695 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APEX1P27695 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APEX1P27695 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APEX1P27695 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APEX1P27695 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APEX1P27695 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APEX1P27695 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APEX1P27695 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
APEX1P27695 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
APEX1P27695 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APEX1P27695 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APEX1P27695 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APEX1P27695 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APEX1P27695 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
APEX1P27695 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APEX1P27695 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APEX1P27695 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APEX1P27695 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APEX1P27695 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APEX1P27695 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms