Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FANCAO15360 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FANCAO15360 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FANCAO15360 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FANCAO15360 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
FANCAO15360 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FANCAO15360 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FANCAO15360 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FANCAO15360 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FANCAO15360 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FANCAO15360 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FANCAO15360 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FANCAO15360 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
FANCAO15360 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FANCAO15360 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FANCAO15360 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
FANCAO15360 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FANCAO15360 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FANCAO15360 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FANCAO15360 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
FANCAO15360 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FANCAO15360 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FANCAO15360 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FANCAO15360 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FANCAO15360 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FANCAO15360 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FANCAO15360 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FANCAO15360 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FANCAO15360 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FANCAO15360 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FANCAO15360 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FANCAO15360 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FANCAO15360 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FANCAO15360 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FANCAO15360 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FANCAO15360 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FANCAO15360 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FANCAO15360 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FANCAO15360 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FANCAO15360 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FANCAO15360 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FANCAO15360 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FANCAO15360 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FANCAO15360 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FANCAO15360 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FANCAO15360 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FANCAO15360 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FANCAO15360 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FANCAO15360 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
FANCAO15360 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
FANCAO15360 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
FANCAO15360 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FANCAO15360 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FANCAO15360 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FANCAO15360 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FANCAO15360 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FANCAO15360 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FANCAO15360 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FANCAO15360 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FANCAO15360 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FANCAO15360 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
FANCAO15360 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FANCAO15360 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FANCAO15360 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FANCAO15360 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FANCAO15360 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FANCAO15360 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FANCAO15360 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FANCAO15360 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
FANCAO15360 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FANCAO15360 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FANCAO15360 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FANCAO15360 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FANCAO15360 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
FANCAO15360 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FANCAO15360 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FANCAO15360 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FANCAO15360 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
FANCAO15360 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
FANCAO15360 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
FANCAO15360 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
FANCAO15360 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
FANCAO15360 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
FANCAO15360 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FANCAO15360 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FANCAO15360 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FANCAO15360 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FANCAO15360 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FANCAO15360 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FANCAO15360 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FANCAO15360 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FANCAO15360 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FANCAO15360 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
FANCAO15360 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
FANCAO15360 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FANCAO15360 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FANCAO15360 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FANCAO15360 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FANCAO15360 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FANCAO15360 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms