Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CSRNP3Q8WYN3 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CSRNP3Q8WYN3 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CSRNP3Q8WYN3 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CSRNP3Q8WYN3 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CSRNP3Q8WYN3 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CSRNP3Q8WYN3 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CSRNP3Q8WYN3 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CSRNP3Q8WYN3 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CSRNP3Q8WYN3 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CSRNP3Q8WYN3 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CSRNP3Q8WYN3 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CSRNP3Q8WYN3 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CSRNP3Q8WYN3 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CSRNP3Q8WYN3 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CSRNP3Q8WYN3 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CSRNP3Q8WYN3 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CSRNP3Q8WYN3 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CSRNP3Q8WYN3 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CSRNP3Q8WYN3 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CSRNP3Q8WYN3 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CSRNP3Q8WYN3 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CSRNP3Q8WYN3 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CSRNP3Q8WYN3 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CSRNP3Q8WYN3 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CSRNP3Q8WYN3 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CSRNP3Q8WYN3 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CSRNP3Q8WYN3 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CSRNP3Q8WYN3 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CSRNP3Q8WYN3 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CSRNP3Q8WYN3 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CSRNP3Q8WYN3 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CSRNP3Q8WYN3 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CSRNP3Q8WYN3 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CSRNP3Q8WYN3 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CSRNP3Q8WYN3 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CSRNP3Q8WYN3 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CSRNP3Q8WYN3 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CSRNP3Q8WYN3 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CSRNP3Q8WYN3 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CSRNP3Q8WYN3 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CSRNP3Q8WYN3 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CSRNP3Q8WYN3 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CSRNP3Q8WYN3 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CSRNP3Q8WYN3 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CSRNP3Q8WYN3 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CSRNP3Q8WYN3 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CSRNP3Q8WYN3 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CSRNP3Q8WYN3 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CSRNP3Q8WYN3 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CSRNP3Q8WYN3 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CSRNP3Q8WYN3 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CSRNP3Q8WYN3 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CSRNP3Q8WYN3 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CSRNP3Q8WYN3 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CSRNP3Q8WYN3 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CSRNP3Q8WYN3 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CSRNP3Q8WYN3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CSRNP3Q8WYN3 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CSRNP3Q8WYN3 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CSRNP3Q8WYN3 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CSRNP3Q8WYN3 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CSRNP3Q8WYN3 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CSRNP3Q8WYN3 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CSRNP3Q8WYN3 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CSRNP3Q8WYN3 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CSRNP3Q8WYN3 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CSRNP3Q8WYN3 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CSRNP3Q8WYN3 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CSRNP3Q8WYN3 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CSRNP3Q8WYN3 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CSRNP3Q8WYN3 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CSRNP3Q8WYN3 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CSRNP3Q8WYN3 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms