Protein–RNA interactions for Protein: Q8C735

Lin9, Protein lin-9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin9Q8C735 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lin9Q8C735 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms