Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
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GRIN2AQ12879 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
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GRIN2AQ12879 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
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GRIN2AQ12879 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
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GRIN2AQ12879 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
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GRIN2AQ12879 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
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GRIN2AQ12879 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
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GRIN2AQ12879 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
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GRIN2AQ12879 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
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